1949年11月1日，中国科学院在北京成立，它是中国最高学术领导机构的综合研究中心。首任院长郭沫若，副院长李四光、陶孟和、竺可桢、陈伯达等。科学院下设计划局、编译局、联络局等单位，并将原华北大学研究部、水生生物调查所，前北平研究院各研究所、前中央研究院等各研究所、前中国地理研究所等单位，调整、合并为地理学、物理学、化学、生物学、哲学、社会学等5个方面15个研究单位。随后又有数学、心理、地理等研究所成立。每个研究单位下设若干研究所、室。它主要从事自然科学、哲学、社会科学的基础科学、新兴技术、国民经济和国防建设重大的综合性课题的研究。